تتشابه الفطريات والبكتيريا في عدة جوانب، منها:
كائنات حية دقيقة ذات خلايا وحيدة: كلاهما من الكائنات الحية الدقيقة التي تتكون من خلايا وحيدة.
التواجد في البيئة: تنتشر كل من الفطريات والبكتيريا في البيئة، من التربة إلى الماء والهواء.
وجود أنواع نافعة وأخرى ضارة: هناك أنواع من الفطريات والبكتيريا مفيدة للإنسان، بينما أنواع أخرى ضارة وتسبب الأمراض.
على سبيل المثال، تُستخدم الخميرة (وهي نوع من الفطريات) في صناعة الخبز والبيرة، بينما تُستخدم بعض الفطريات في إنتاج المضادات الحيوية. أما البكتيريا النافعة، فتساعد في تحلل المواد العضوية وإنتاج بعض الأطعمة كالزبادي والجبن.
في المقابل، هناك فطريات وبكتيريا ضارة تسبب أمراضًا جلدية وعفونات غذائية، وأمراض معدية كالالتهاب الرئوي ومرض السل.
إذن، يمكن القول إن التشابه الرئيسي بين الفطريات والبكتيريا هو أنهما كائنات حية دقيقة تتواجد في البيئة، وتشمل أنواعًا نافعة وأخرى ضارة.